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Genómica computacional
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  • Genómica computacional

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  • Title
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  • Índice
  • Introducción
  • Objetivos
  • 1. Navegadores genómicos
  •     1.1. Conceptos básicos
  •     1.2. Filosofía de la navegación genómica
  •     1.3. El navegador genómico UCSC: estructura
  •     1.4. El navegador genómico UCSC: pistas
  •     1.5. El navegador genómico UCSC: anotaciones propias
  •     1.6. El navegador genómico UCSC: ENCODE
  •     1.7. El navegador genómico UCSC: navegador de tablas
  •     1.8. El navegador genómico UCSC: instalación local
  •     1.9. El navegador genómico ENSEMBL
  •     1.10. La aplicación GALAXY
  • 2. Comparaciones de secuencias
  •     2.1. Alfabetos, secuencias y alineamientos
  •     2.2. Interpretación biológica de los alineamientos
  •     2.3. Alineamientos globales o locales
  •     2.4. Alineamientos simples o múltiples
  •     2.5. Matrices de puntos
  •     2.6. Alineamientos óptimos de secuencias
  •     2.7. Alineamientos progresivos de secuencias
  •     2.8. Identificación de motivos conservados
  •     2.9. Búsquedas masivas en bases de datos
  •     2.10. Alineamientos de genomas
  • 3. Anotación de genomas
  •     3.1. Anotación del paisaje genómico
  •     3.2. Modelos computacionales de señales y regiones
  •     3.3. Arquitectura de los genes y sus regiones reguladoras
  •     3.4. Predicción de genes ab initio
  •     3.5. Predicción de genes por homología
  •     3.6. Caracterización de regiones reguladoras
  •     3.7. Impronta evolutiva de regiones reguladoras
  •     3.8. Evaluación de las predicciones
  • Resumen
  • Actividades
  • Ejercicios de autoevaluación
  • Solucionario
  • Bibliografía



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