Will y Drake se enteran por Eddie, el antiguo Limitador, que la raza de los styx está entrando en la Fase, una etapa de su ciclo vital que sólo se ha producido dos o tres veces a lo largo de los milenios. Una nueva Fase significaría la rápida producción de un ejército de Limitadores de la Clase Guerrera styx, con devastadoras consecuencias para el país por los estragos que causaría entre la población de la Superficie.

El padre de Drake, Parry, monta una operación militar para destruir un almacén donde está teniendo lugar la Fase. Al concluir, todos creen que las mujeres styx al completo han sido liquidadas y la Fase abortada, hasta que un vídeo de seguridad guardado en un disco duro revela que dos de ellas han conseguido burlar el cerco. Una de esas mujeres, Hermione, se esconde en la Superficie, mientras que la otra, Vane, se encamina al mundo interior. Cada una de ellas pretende volver a iniciar la Fase, aunque nada les garantiza que logren tener éxito.

Ésa es la buena noticia.

La mala es que la mitología styx habla de un posible segundo ciclo reproductivo, en la práctica un respaldo en el supuesto de que la Fase no se pueda llevar adelante. Esto tendría unas implicaciones aún peores para la raza humana, ya que engendraría a los bastante más mortíferos Armagi, unas bestias asesinas capaces de adaptarse rápidamente a los diferentes entornos y de regenerarse después de ser heridas.

Mientras Will y el equipo se reagrupan para planear su siguiente movimiento, Danforth ha elaborado su propio plan para desertar y pasarse a los styx. Pero cuando hace su jugada, provoca la muerte de los padres de Chester y sepulta a todos en el Complejo, la fortaleza estatal horadada en las profundidades de una montaña escocesa.

Después de que el equipo consiga finalmente escapar del Complejo, Parry y Eddie permanecen en la Superficie con los miembros de la Vieja Guardia, con la misión de seguirle el rastro a Hermione y matarla. Previendo que su hermana, Vane, vaya a intentar utilizar a la población de Nueva Germania como huéspedes en la nueva Fase, Drake, con Will, Elliott, Sweeney y el coronel Bismarck, encabeza una misión al mundo interior. Su cometido consistirá en sellar el pasadizo de los Antiguos y el Poro, las dos únicas vías de entrada o salida al mundo interior, con unas explosiones nucleares.

Sin embargo, antes de que los artefactos puedan ser detonados, Drake y su equipo se ven sorprendidos en el Poro por Vane, Rebecca Uno y un escuadrón de Limitadores.

El coronel Bismarck muere por los disparos de los Limitadores, y en la contienda subsiguiente, la ayuda les llega de una dirección inesperada. Para total sorpresa de Drake y los demás, Jiggs los ha estado siguiendo hasta el mundo interior, y ahora entra en acción. Tras rebanarle el cuello a un Limitador, deja a un segundo fuera de combate arrastrándole con él al interior del Poro. Drake se ve obligado a hacer lo propio con la gemela styx, pese a lo cual es capaz de detonar a distancia la bomba nuclear mientras cae hacia el cinturón de gravedad cero.

Sweeney pierde la vida por hallarse demasiado cerca de las radiaciones electromagnéticas de la explosión nuclear, que le achicharran los circuitos implantados en la cabeza. Cuando cae al suelo, aplasta una probeta que lleva en el bolsillo y libera sin querer un virus mortal procedente de la Ciudad Eterna, el cual no sólo extermina a todos los humanos y styx presentes en el mundo interior, sino prácticamente a todas las demás especies. Will y Elliott sobreviven al virus porque han sido vacunados contra el germen patógeno, pero ahora quedan atrapados en el «Jardín del Segundo Sol» del doctor Burrows, sin que aparentemente cuenten con recursos para regresar a la corteza exterior.

En la Superficie, en una aislada casa de campo de la costa de Pembrokeshire, el Viejo Wilkie y su nieta Stephanie atienden a Chester mientras éste intenta superar la muerte de sus padres.

Aunque en el mundo interior la Fase ha sido abortada, los esfuerzos de Hermione en la Superficie han dado sus frutos, y los mortíferos Armagi han sido engendrados.

Esta última entrega de la serie Túneles retoma la historia momentos antes de que tenga lugar la explosión nuclear en el Poro, mientras Jiggs lucha por su vida…